Vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok. Videó: ArcGIS Survey123: Create Feature Reports 2021, Április

Prognosztikus markerek Absztrakt Az elmúlt vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok a vastagbélrák molekuláris felosztására több gén-expressziós alapú altípust javasoltak. Célunk volt, hogy ezeket a besorolókat keresztre érvényesítsük annak érdekében, hogy megismerjék az egyeztetésüket és a túlélés megjósolására vonatkozó képességüket. Létrehoztunk egy 2 db mintából álló, 12 független adatsorból álló gén-chip alapú adatbázist. A túléléssel való korrelációt Cox arányos veszélyek regressziójával értékeltük minden egyes osztályozó esetében relapszusmentes túlélési adatok felhasználásával.

Vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok. Rák (betegség)

A túlélés legmagasabb hatékonyságát a Végül a négy független vizsgálatból származó 61 vastagbélrák sejtvonalat a legközelebbi molekuláris altípushoz rendeltük. Bevezetés A vastagbélrák CRC a rákkal kapcsolatos halálok negyedik fő oka. A kemoterápia és a célzott terápia meghaladja a túlélést a korai betegségben szenvedő betegeknél 30 hónapig 1.

A hatóanyagok jelenlegi csoportja az 5-fluorouracil, a kapecitabin, az irinotekán és az oxaliplatin citotoxikus ágensei; az angiogenezis inhibitorok bevacizumab és aflibercept; az anti-EGFR antitestek cetuximab és panitumumab; és a vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok inhibitor regorafenib.

Ezen túlmenően számos további hatóanyag fejlesztés alatt áll, így hamarosan majdnem minden genetikai változást meg lehet célozni. Azonban a vastagbélrák nem egyetlen betegség, hanem inkább ugyanolyan klinikai megjelenéssel rendelkező, molekulárisan megkülönböztető betegségek halmaza 2.

Így személyre szabott terápia céljának eléréséhez először a betegeket klinikailag releváns molekuláris altípusokra kell rétegezni. Elvben az egyes gének vagy gén aláírások használata lehetséges.

vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok helmintox összetétele

Másrészről, az elmúlt évtizedben számos, a tumormintákból származó génexpressziós profilt használó multigén aláírások jelentek meg. Ezek a betegeket molekuláris altípusokba sorolják, melyek két és hat között mozognak.

A legtöbb ilyen osztályozó a kockázati előrejelzésre összpontosít - hasonlóan más onkológiai rendellenességekhez, mint például a mellrák lásd a 7. Elvileg ez a megközelítés terápiás szempontból hasznos, feltéve, hogy a nagy relapszus kockázatú betegek a kemoterápia előnyeit is előnyben részesítik.

Azonban a javasolt altípusokkal kapcsolatban számos megoldatlan probléma merül fel. Annak ellenére, hogy következményei pinwormok ilyen besorolási séma teljesítményét független betegcsoport segítségével értékelték, eddig egyetlen vizsgálat sem hasonlította össze őket ugyanazon betegcsoporttal.

vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok szemölcsök a torkon viszket

Másodszor, a klinikailag releváns altípus kiválasztása a betegből származó anyag felhasználásával nem biztosítja az eredmények közvetlen transzlációját a betegterápiára. Ebből a célból az adott részterületre jellemző ágenseket megfelelő modellrendszerben kell kifejleszteni és tesztelni.

Mindazonáltal az eddigi tanulmányok egyike sem szolgáltatott útmutatót a preklinikai vizsgálatok e kezdeti lépéséhez.

vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok a papilloma parazita az emberi testben

Ebben a tanulmányban célul tűztük ki, hogy a közzétett molekuláris altípusokat ugyanazt a betegcsoportot alkalmazzuk. A molekuláris altípusok egymással való összehasonlítása mellett a túlélés előrejelzésére vonatkozó képességük alapján is rangsoroltuk őket.

Ezen túlmenően, a kolorektális ráksejtvonalak gén expressziós aláírásait kaptuk, és minden egyes sejtvonalat meghatároztuk, hogy azonosítsuk az egyes altípusok legreprezentatívabb preklinikai modelljét.

Eredmények Validációs adatok és klinikai jellemzők Az 1A. Ábrán egy GEO-keresésből kiinduló adatbázis-konstrukció összefoglalása látható.

vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok hány féreg él az emberi testben

Vagy III. A medián relapszusmentes túlélés 43, 12 hónap és a medián életkor 69 év volt. Az validációs elemzés során használt teljes adatbázis összesített klinikai paramétereit az 1B. Ábrán mutatjuk be, és az egyes adathalmazok klinikai tulajdonságait, beleértve a nemet, a fokozatot, az MSI-t, a stádiumot, az életkorot és a helyet, az 1. A teljes adatbázis összetétele - a benne foglalt 12 adatkészlet és az alapvető klinikai jellemzők - a minták száma a TNM-hez van megadva, mivel ezek az adatok csak a betegek egy töredékéért álltak rendelkezésre B.

Összefüggés a túlélés, a TNM és a szakasz között a teljes adatbázisban C. Az osztályozók azonosítása PubMed keresés D segítségével. Vagy a közzétett kiegészítő anyag felhasználásával, vagy az eredeti képzési adatállományok kihasználásával 22 Ezeknek a.

Rák (betegség)

Az 1D. Ábrán a jelöltosztályozó azonosításának folyamatábrája látható. Az összes 22 osztályozó teljes listáját, beleértve a betegek jogosultságát, az osztályozási algoritmus részleteit és az eredeti kiadványban használt képzési és érvényesítési készlet paramétereit, az 1. Teljes méretű asztal Az osztályozók összetételének összehasonlításához és az egyes gének teljesítményének felméréséhez kivontuk az egyes osztályozókban szereplő gének listáját lásd a 2.

Ezután a géneket rangsoroltuk, miután a markerek mindegyikének génpontját kiszámítottuk. Összhang az osztályozási teljesítményben A következő lépésben az egyes betegek mindegyikét az egyes osztályozók egyik altípusához rendeltük. Mivel a besorolás általános alapja a minták jó prognózisú és rossz prognózisú csoportok szerinti megoszlása, lehetséges, hogy a besorolási filiális paraziták összevetése több osztályozóra is értékelhető.

A Cramer V értékei az egyes párok esetében a 4. Az összes minta A összes osztályozója és a minták rossz piros vagy jó zöld prognózisának azonosítására a II. Mindegyik esetben az 1-es Cramer V-je tökéletes egyeztetést jelent, és 0 egyenlő a teljes ellentmondással.

Az osztályozókban C szereplő gének listájának százalékos átfedése. Teljes méretű kép Kimerítőbb értékelésre van lehetőség, ha a minta jó vagy rossz prognózisú csoportba sorolását külön-külön értékelik. Ez a megközelítés különösen fontos, mert általában nincs lehetőség vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok, hogy az egyes osztályozókat külön-külön végezzék el, és így az egyes vizsgálatok eredményei eldobható féreghajtó szer nagy összhang lehetővé teszi a vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok értelmezést.

Mivel az ilyen korreláció a legjelentősebb a prediktív potenciállal rendelkező tesztek esetében, részletes elemzést végeztünk a nyolc legjobb teljesítményű tesztre. Ábra részletes eredményeket mutat a minta jó vagy rossz prognózisú azonosítására. A besorolási egyeztetésen kívül összehasonlítottuk a teszteket tartalmazó gének arányos átfedését is. Az összes vizsgálat eredményeit a 2C.

A túlélés megjóslására vonatkozó erő minden molekuláris osztályozó esetében eltérő A klinikai és patológiás paraméterek és a túlélés közötti összefüggések vizsgálatakor a legerősebb jelentőséget érte el az I. A szignifikancia magasabb volt az I. Stádium összehasonlításakor, de alacsony mintaszámmal.

A színpadra és a TNM-re vonatkozó túlélési ábrákat az 1C. A túlélési analízist először a II. És III. Mivel a veszélyességi ráta kiszámítása csak két kohort tartalmazhat, minden osztályozó esetében a legjobb és legrosszabb teljesítményű altípusokat választottuk ki.

Az összes osztályozót felsoroló erdőterület a 3A. Ábrán látható, és a 22 osztályozó mindegyikének túlélési diagramja az 1. Hasonló eredményeket kaptunk mindegyik betegnél a 2. Stádiumban lévő betegeknél a 3.

  • A magyar orvosok felkészültek, jól képzettek Vastagbélrák konszenzus molekuláris altípusok
  • Helmint típusú gyermekeknél

Az egyes KM-telkeket az 5. Fázisú betegek összes osztályozójának teljesítményét bemutató erdőterület A. A több mint két kimenettel rendelkező osztályozók hpv impfung mann kosten a legjobb és legrosszabb teljesítményű kohorszokat összehasonlították a veszélyességi arány kiszámításakor.

Végül egy további elemzésben a 2.

  • Rák (betegség) – Wikipédia
  • Ornidazol giardiasis kezeléssel

Az aláíró taggének hatása az általános prognosztikai erőre Az osztályozókba tartozó gének teljesítményének értékeléséhez először egyváltozós túlélési elemzést végeztünk az összes génhez.

Ebben a megközelítésben a gének medián expresszióját használtuk két csoport meghatározására. Ezután értékeltük az egyes osztályozókon belül szignifikáns gének százalékos arányát. Összehasonlítottuk a szignifikáns gének arányát az osztályozók által elért HR értékekkel Spearman Rank korrelációval.

Preklinikai sejtvonal modellek hozzárendelése A 61 jogosultsági kritériumnak megfelelő 61 egyedi sejtvonalból géncsoportot azonosítottunk.

A sejtvonal tömbök között nem volt többször közzétett gén chip. A leggyakrabban használt sejtvonalak osztályozását a legfontosabb gének mutációs állapotával minden molekuláris osztályozó számára a 2.

Az egyes sejtvonalak részletes besorolása az egyes osztályozókhoz a 6. Teljes méretű asztal Annak érdekében, hogy a preklinikai modelleket altípusokhoz kapcsolják, minden egyes osztályozó esetében megvizsgáltuk az altípus-jelölés arányát az összes altípushoz és az adott altípushoz rendelkezésre álló sejtvonalak számát.

Számos osztályozónak több megfelelő sejtvonal modellje van pl. A legjobb teljesítményű osztályozók eredményeit a 4. Az egyes osztályozókra vonatkozó altípus-jelölési arány minden betegben bal oszlop, százalékbanés az adott altípushoz jobb oszlop, n rendelkezésre álló sejtvonalak száma a legjobb teljesítményű osztályozók számára.

A szürke minden osztályozóban megfelel az NA-nak.

Fontos információk